ncbi,ncbi怎么查质粒序列
ncbi,ncbi怎么查质粒序列?
一般打开ncbi的网页,选择核酸数据库,输入质粒名称或序列号,点击查询就可以看到相应的质粒,当然,这个质粒必须是在数据库中才行。
ncbi怎么比对引物的专一性?
在NCBI 上比对,如果引物序列只与设计的那个(类别)的物种相似度比较高而与其他的物种的相似度比较低,就是特异的了
请教下NCBI中blastn和p?
blastn 是用DNA序列去检索其匹配序列时的选项,告诉程序你的序列是核酸序列,你希望检索核酸库,是最常用的一种检索方式。
balstp是用蛋白序列去检索时的选项。blastx是你希望数据库把你提交的序列去同时检索DNA库和蛋白库。tblastn是你提交的是DNA序列,你希望程序自动将其翻译后去检索相匹配的蛋白序列。所以,选择什么检索方式是根据你提交的序列种类和你希望检索出来的序列种类来决定的。美国国家生物技术信息中心?
(NCBI维护的数据库)NCBI的主要工作是在分子水平上应用数学和计算机科学的方法研究基础生物,医学问题。为科学界开发,维护和分享一系列的生物信息数据库;开发和促进生物信息学数据库,数据的储存,交换以及生物学命名规则的标准化。
如何找一个基因的转录起始位点?
你看自己做的那个物种有没有基因组序列,如果有在NCBI中先找到自己要做的基因,然后找到基因组序列,做blast后在基因组上选取上游的大概1000多个碱基,然后用软件分析,一般就找到转录起始位点了,转录起始位点也就在启动子位置。
如果没有基因组序列,就比较麻烦,需要用染色体位移技术,先克隆到哪个序列,在用软件做分析。用软件分析后,还需要用实验验证,才能完全确定你需要的转录起始位点。
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